Смотря что чистить. Если логическую структуру, темповкие папки, временные файлы интернета, чистка системы охлаждения и так далее, то я бы рекомендовал программу — «Компью-помощь». Есть у Windows свои внутренние ресурсы, которые могут освободить место на диске. Но они к сожалению не многофункциональны. Приходиться обращаться к другим разработчикам, которых на рынке очень много. Они разработали программное обеспечения для поддержки операционной системы Windows. Которые могут почистить систему Виндовс, как в ручном режиме, так и в автоматическом. Reg Organizer, Ccleaner, TuneUp Utilities и так далее …
Данная статья на тему чистка Windows может быть весьма кстати: